Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms