Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms