Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms