Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP88Q99567 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP88Q99567 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms