Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms