Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms