Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms