Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCLRE1CQ96SD1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms