Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms