Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YTHDC1Q96MU7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms