Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms