Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP53Q96M91 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms