Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms