Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZC2HC1AQ96GY0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZC2HC1AQ96GY0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms