Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FAM3DQ96BQ1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3DQ96BQ1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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