Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTI1AQ96AJ9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms