Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFKQ969G6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms