Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDAQ92838 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDAQ92838 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDAQ92838 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDAQ92838 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDAQ92838 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms