Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms