Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms