Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM3Q8NE01 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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