Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00116Q8NCU8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms