Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RETREG2Q8NC44 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms