Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms