Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC2Q8N158 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC2Q8N158 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms