Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX4Q8IY92 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX4Q8IY92 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms