Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC6Q8IVU3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms