Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR1Q8IVT5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KSR1Q8IVT5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms