Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGMS1Q86VZ5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms