Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP1Q7Z6B7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms