Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC6Q7Z403 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC6Q7Z403 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms