Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9AQ7Z3C6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms