Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSX7Q7RTT5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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