Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP1Q7RTM1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms