Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM179Q6ZVK1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM179Q6ZVK1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms