Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTE2Q6XPS3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms