Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms