Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms