Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FIP1L1Q6UN15 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms