Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC137Q6PK04 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms