Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms