Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD2Q6P5Q4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD2Q6P5Q4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms