Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMBOX1Q6NT76 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms