Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC70Q6NSX1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms