Protein–RNA interactions for Protein: Q6DT37

CDC42BPG, Serine/threonine-protein kinase MRCK gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPGQ6DT37 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42BPGQ6DT37 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42BPGQ6DT37 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42BPGQ6DT37 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42BPGQ6DT37 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42BPGQ6DT37 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42BPGQ6DT37 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42BPGQ6DT37 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42BPGQ6DT37 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42BPGQ6DT37 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42BPGQ6DT37 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42BPGQ6DT37 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42BPGQ6DT37 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42BPGQ6DT37 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms