Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms