Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD2Q68DH5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD2Q68DH5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD2Q68DH5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD2Q68DH5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms