Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms