Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms