Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms